北京治疗妇科疾病比较好的医院有1、北京协和医院，2、北京大学第三医院，3、北京大学人民医院，4、北京大学第一医院，5、北京天坛医院；北京协和医院妇科疾病医疗设施齐全，在妇科疾病治疗方面有着丰富的经验；北京大学第三医院妇科疾病医疗储备人员丰富，对妇科疾病有着独到的见解和优势。