六大问带你看懂 RNA 质控金标准-RNA 完整值 (RIN)

第一问：RIN值是什么？
RIN全称RNA integrity number，是安捷伦公司开发的应用于自动化电泳系统2100生物分析仪中用来评价RNA完整性的一个指标。

第二问：为什么要测RNA完整性？
评价RNA完整性是核酸质控的一种，对后续实验的准确性很重大意义。可以被看做是获得有意义基因表达数据的第一个关键步骤。采用完整的RNA是下游做基因定量，测等实验成功的关键要素。

第三问：RIN值是如何开发的？
RIN值是针对使用安捷伦2100生物分析仪检测真核生物总RNA系统来开发的。安捷伦用科学家采集了来自于人，大鼠，小鼠的不同组织约1300份样本的总RNA数据，并对其进行分析。所有的样本RNA完整程度都不相同。科学家们预设了1-10的编号，并将这些样本手动分类至对应的编号（数字越大，完整性越好）。

IN算法是基于神经网络等自适应学习工具开发而成。这些学习工具可以从电泳图中提取的关键特征，例如信号面积，强度和比值。以图1举个列子，电泳图被分为不同区域（前区、5S区、快速区、中区、前体区、后区）和峰（标准品、18s、28s）。安捷伦2100生物分析仪配套分析软件可以根据检测结果生成RIN值。
 

图 1 电泳图分区

第四问：RIN值怎么看？
RIN值可以设置为整数，见图2。 数字越大，代表RNA完整性越高，数字越小，表示RNA降解的越厉害。一般在测序应用中，一般推荐RIN值要大于7；若RIN＜6，会建议重新送样；RIN在6-7之间，存在测序风险。
 

图 2 不同RIN值代表的RNA完整性

第五问：RIN值如何应用？
用安捷伦2100生物分析仪测量RIN值是检测RNA完整性的有力工具。在提取样本RNA之后检测RIN值，同时需要和下游实验例如qPCR等建立关联，设定一个下游实验成功与否的RIN阈值。该阈值可作用于标准RNA质量控制。检测的RIN值大于阈值的样本通过质控QC检验，而低于阈值的样本则要被去除。
 

第六问：为什么选择检测RIN值？

更加快捷，省时
相比较于传统人工电泳实验，采用安捷伦2100生物分析仪，一次可以同时检测5-12样本，节省时间。

减少实验步骤，省力
安捷伦2100生物分析仪搭配检测芯片，无需配胶，无需手动跑胶，大大减少了繁琐的实验流程，相应的也减少了人为误差。

准确度高，省心
经过实验论证，采用RIN值计算RNA完整性的变异系数是为1.4%，远低于采用核糖体比率计算的结果。在不同浓度的样品中，RIN评估的结果也高于核糖体比率。使用RIN值完全可以作为评估RNA完整性的靠谱标准！
 

RIN值这么好，广告少不了！
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今天的分享就到这里了，下一次小编鲁大师会给您带来如何用安捷伦2100生物分析仪做实验哦。青山不改，绿水长流！我们下周再见！