从零开始认识c-MET(上)——基础篇
2022/5/2 14:01:26 与爱共舞订阅号

    

    

     作者:小山丘的旅行

     对非小细胞肺癌患者来说,MET扩增或突变,是我们绕不开的靶点。确诊时发现,或者靶向耐药后出现,都会影响我们接下来的治疗跟选择。

     一、主要关注类型

     c-MET通路的异常激活: 过表达,基因变异(扩增,突变,融合和反式激活等)。

    

     (MET异常激活-文献16)

     我们重点关注:MET-14跳跃突变、MET扩增、MET蛋白过表达

    

     我们不太认为MET过表达是肿瘤的驱动因素,倾向认为它是基因异常激活发生的二次事件。考虑到它的预后相关,以及各癌种不低的发生率(比如乳腺癌35-65%,胃癌30-70%,肝癌25-60%,肾细胞癌15-80%等),我们通常也将它列为了解的重点。

     二、检测方法

     NCCN指南建议,对于EGFR-TKI耐药患者,如果没有检测到T790M,应考虑进行MET扩增复测。提示了MET检测的必要和重要性。

     MET过表达

     免疫组化IHC检测,便宜、快速,很多医院将它作为病理操作的常规项。

    

     MET高表达+++相对有价值一些。虽然不太能直接指导治疗,但如果靶向耐药后检测不到明确的耐药因素 或者基因检测到EGFR/ALK突变但用药仍在进展的,高表达或许能提示我们往MET方向考虑,甚至盲联。

     MET-14跳跃

     RT-PCR跟二代NGS测序是主要方法,推荐二代测序NGS。

     理由:

     ①RT-PCR快速便宜,但缺乏质控标准,假阴性也多;

     ②NGS技术的位点/类型覆盖较全,更能匹配MET-14跳跃的多样及共突变情况 (可能检出的MET-14exon点突变,虽然发生频率不高,但可能产生和MET-14skipping类似的生物学结果,影响MET通路。例如某肺腺癌病友,液体NGS检出MET Y1003s突变,克唑替尼用药效果良好,持续缓解近1年。)

     液体NGS检测存在漏检,漏检率可能达36%,也就是常说的“检出率问题”。

     为了提高检出,NCCN指南推荐在DNA-NGS测序后,可以增加RNA-NGS检测补充。(根据哥伦比亚大学医学中心的回顾分析,液体ctDNA panel检测到2.5%,但后续通过RNA验证检测时增加到3.9%。)

     MET扩增

     临床常用的检测技术:FISH法(医院/不贵)和NGS测序(院外/基因检测)。

     条件理想的话,FISH和NGS都进行检测

     理由:

     FISH检测可以较好地筛选出MET靶向获益患者,而NGS可以更全面的了解MET和非MET的基因异常情况。

     ①MET扩增形式=定点扩增+多倍体

     FISH或NGS检测值,并不意味着都是有治疗意义的MET扩增及用药有效。

     因为较低水平的检测值,很可能不是因为MET定点扩增,而只是肿瘤细胞的7号染色体重复引起的拷贝数增加而已,即我们讲的MET多体或多倍体。

    

     (来源:91360智慧病理网:MET突变/扩增/14外显子跳跃突变检测方法的系统总结及注意事项)

     ②组织FISH的Cut-off值

     组织FISH是临床研究常用的检测法,多倍体和定点扩增均能检出,被认为是MET扩增检测的金标准。

    

     从表格里的3个经典临床看,MET扩增程度和不同药物的响应率有关。不同MET扩增水平,疗效数据明显不一样。

    

     (MET基因扩增与病人响应率关系-文献11)

     为更好的预测、筛选区分MET用药的获益人群,我们有必要对检测值进行划分。

     按Cappuzzo和UCCC标准,我们把FISH拷贝数GCN≥5或MET/CEP7比值≥2.0的定义为MET扩增(定点扩增),而如果是GCN<5或MET/CEP7比值<2,则定义为MET多倍体。[5]

    

     实际上,以上的划分标准也没有成为共识,临床患者的筛选经常不同。好在偏差也不会很大。综合PROFILE 1001研究和上面的标准,一般划分为:

    

     ③NGS检测的Cut-off值

     液体NGS

     液体NGS检测,是可行的选择。毕竟,每次都进行组织活检不太现实。缺点在于检出率问题。而且液体NGS对检测技术要求较高。这方面的检测,推荐找大公司进行检测,虽然价格高一些。

     Le X,ASCO2021:基于Guardant 360试剂盒进行NGS液体检测,GCN≥2.5为MET扩增阳性。特泊替尼的VISION试验也是以此为参考进行入组筛选。

     组织NGS

     Camidge R,JTO 2020 及Wolf J,NEJM 2020:基于FoudationONE CDX检测GCN≥6为MET扩增阳性的Cut-off值。

    

     (来源:2021ASCO Annual Meeting)

     NGS检测出的拷贝数GCN<6就意味着不是定点扩增,用药无效么?也不见得。只能说GCN≥6的疗效相对更好。

     同时应该了解的是,组织NGS同样存在检出率的问题。可能是NGS对多倍体/真性扩增的生信解读存在过滤问题,也可能是样本质控等问题。

     参考TATTON 1b 期的研究,质控标本的肿瘤细胞≥20%,可能更有利于准确检测。

    

     MET融合

     NGS二代测序应该更有优势。

     三.发生情况

    

     按已有的临床询证,重点关注的是MET-14跳跃和MET扩增。典型的,像上图中的肺肉瘤样癌PSC,MET-14跳跃突变发生率达到了20-31.8%,比例很高。

     MET扩增:原发+继发

     虽然MET扩增的患者可能有50%以上有吸烟史,但MET扩增水平跟性别、吸烟不见得有关系。

     (1)原发MET扩增,也就是MET异常引起,而不是因靶向或治疗耐药后得到。肺腺癌患者里,它的发生率大概2-4%。

     其中,低水平的原发MET扩增,可能有50%携带其他驱动基因异常。而高水平的扩增,较少出现驱动基因共存的情况(如罕见的原发MET扩增+EGFR突变)。

     (2)继发MET扩增,也叫获得性MET扩增,是很常见的肿瘤耐药机制之一。比如EGFR突变的患者,在使用一段时间EGFR靶向药后,出现了MET基因异常导致EGFR-TKI耐药和进展。

    

     ①EGFR突变患者的获得性耐药

     上海胸科医院回顾性研究,NGS检测:原发MET扩增3.27%(82/2507),EGFR靶向药耐药后获得的MET扩增16.04%。

     其中,EGFR 1/2代靶向耐药后约占5~10%左右。一线奥希替尼耐药后大概是10-15%(III 期 FLAURA 试验15%)。二线奥希替尼耐药后的MET耐药约15-25%(III 期 AURA3 试验的血液样本测序有19%)。

    

     基于获得性MET突变的发生率不低,NCCN和CSCO指南均提到,EGFR靶向耐药后,除了T790M检测外,可以考虑做个MET扩增检测

     ②ALK突变患者的获得性耐药

     分析136例ALK患者,靶向耐药后的组织/血液标本,约15%存在MET扩增。其中二代阿来替尼/塞瑞替尼耐药后12%,三代劳拉替尼耐药后22%。

     整体来说,一线克唑替尼后再用二代药出现的MET扩增大概9%,而一线阿来替尼/塞瑞替尼再用劳拉替尼出现MET扩增的概率大约在33%。

     MET-14跳跃

     非小肺癌中,MET-14跳跃在确诊时的发生率大概3-4%,在已知的NSCLC驱动基因中排第四。男性>70岁的晚期患者群体比较多见。常见于肉瘤样癌4.9-31.8%,腺鳞癌4-8%,鳞癌1-2%。

    

     (MET外显子14跳跃突变的发生率-文献17)

     ASCO2020报道,1387例NSCLC患者组织基因NGS检测,总计发现2.3%存在MET-14跳跃突变。而在这些患者里,跟EGFR突变同时发生的情况非常罕见(仅0.65%),但同时存在MET扩增的可能有15-20%。

     一些研究显示,MET-14跳跃突变患者,如同时伴随MET扩增或MET高表达,则MET抑制剂疗效可能更好。

     MET融合

     MET融合基因类型有:SLC1A2-MET,PTPRZ1-MET,KIF5B-MET,HLA-DRB1-MET等。

     尽管发生率非常低,但现有的报道表明MET融合基因在肺癌中具有致癌活性。其中,肺腺癌的MET融合发生率据报道为0.5%。

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     参考文献

     ⑴Lai GGY, Lim TH, Lim J, et al. Clonal MET Amplification as a Determinant of Tyrosine Kinase Inhibitor Resistance in Epidermal Growth Factor Receptor-Mutant Non-Small-Cell Lung Cancer. J Clin Oncol. 2019 Apr 10;37(11):876-884.

     ⑵Canadian Consensus Recommendations on the Management of MET-Altered NSCLC(2021)

     ⑶肺癌获得性MET D1228V突变及对MET抑制剂的耐药性: Cancer Discov. 2016 December ; 6(12): 1334–1341. doi:10.1158/2159-8290.CD-16-0686.

     ⑷Acquired MET Y1248H and D1246N Mutations Mediate Resistance to MET Inhibitors in Non–Small Cell Lung Cancer.Published OnlineFirst April 10, 2017; DOI: 10.1158/1078-0432.CCR-16-3273

     ⑸Gillianne G.Y. Lai,et al.Clonal MET Amplification as a Determinant of Tyrosine Kinase Inhibitor Resistance in Epidermal Growth Factor Receptor–Mutant Non–Small-Cell Lung Cancer.Journal of Clinical Oncology.January 24, 2019: DOI https://doi. org/10.1200/JCO.18.00177

     ⑹Camidge RD, Ou S-HI, Shapiro G, et al. Efficacy and safety of crizotinib in patients with advanced c-MET-amplified non-small cell lung cancer. J Clin Oncol 2014;32(Suppl 5):Abstract 8001.

     ⑺Wolf J, Seto T, Han JY, et al. Capmatinib in MET Exon 14-Mutated or MET-Amplified Non-Small-Cell Lung Cancer. N Engl J Med. 2020 Sep 3;383(10):944-957. doi: 10.1056/NEJMoa2002787.

     ⑻Paik PK, Felip E, Veillon R, et al. Tepotinib in Non-Small-Cell Lung Cancer with MET Exon 14 Skipping Mutations. N Engl J Med. 2020 Sep 3;383(10):931-943. doi: 10.1056/NEJMoa2004407.

     ⑼Recondo G, Bahcall M,et al. Molecular Mechanisms of Acquired Resistance to MET Tyrosine Kinase Inhibitors in Patients with MET Exon 14-Mutant NSCLC. Clin Cancer Res. 2020 Jun 1;26(11):2615-2625. doi: 10.1158/1078-0432.CCR-19-3608. Epub 2020 Feb 7. PMID: 32034073.

     ⑽OA15.04 - Telisotuzumab Vedotin (teliso-v) Monotherapy in Patients With Previously Treated c-Met+ Advanced Non-Small Cell Lung Cancer.2021 World Conference on Lung Cancer

     ⑾Robin Guo et al, MET-dependent solid tumours - molecular diagnosis and targeted therapy,Nat Rev Clin Oncol . 2020 Sep;17(9):569-587.

     ⑿Mark M. Awad, et al. Characterization of 1,387 NSCLCs with MET exon 14 (MET-14) skipping alterations (SA) and potential acquired resistance (AR) mechanisms. Presented at: 2020 ASCO Virtual Scientific Program; May 29, 2020. Abstract 9511.

     (13)Kron A, , et al. Genetic heterogeneity of MET-aberrant non-small cell lung cancer and its impact on the outcome of immunotherapy.J Thorac Oncol.2020. DOI:10.1016/j.jtho.2020.11.017

     (14)Sabari JK, Leonardi GC, Shu CA, et al: PD-L1 expression, tumor mutational burden, and response to immunotherapy in patients with MET exon 14 altered lung cancers. Ann Oncol.2018 DOI: 10.1093/annonc/mdy334

     (15)Yasuhiro Kato,et al.Long-term efficacy of immune checkpoint inhibitors in non-small cell lung cancer patients harboring MET exon 14 skipping mutations. Int J Clin Oncol.2021 DOI: 10.1007/s10147-021-01893-0

     (16)Hang-Ping Yao et al, Progress and challenge in development of biotherapeutics targeting MET receptor for treatment of advanced cancer,Biochim Biophys Acta Rev Cancer . 2020 Dec;1874(2):188425.

     (17)Socinski, Mark A et al. “MET Exon 14 Skipping Mutations in Non-Small-Cell Lung Cancer: An Overview of Biology, Clinical Outcomes, and Testing Considerations.” JCO precision oncology vol. 5 PO.20.00516. 13 Apr. 2021, doi:10.1200/PO.20.00516

    

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